В 2006 г. Москва, как один из субъектов РФ приняла участие в конкурсе по созданию и развитию инфраструктуры поддержки субъектов малого предпринимательства (бизнес-инкубаторов), который проводило Министерство экономического развития и торговли РФ.
По итогам конкурса в двух округах Москвы (Северо-Западном и Зеленоградском) при участии федерального (30%) и городского (70%) бюджета создаются бизнес-инкубаторы для малых предприятий в сфере высоких технологий.
Создание бизнес-инкубатора осуществлялось совместно Департаментом поддержки и развития малого предпринимательства города Москвы и префектурой Зеленоградского административного округа.
Общая площадь здания бизнес-инкубатора — 6 670,3 кв. м. Непосредственно бизнес-инкубатор «Зеленоград» занимает шесть верхних этажей здания общей площадью 3 017,3 кв. м, что позволяет разместиться на его территории около 30 организациям малого бизнеса. С 1 по 4 этажи располагаются окружные организации инфраструктуры поддержки малого и среднего предпринимательства.
Приоритетными организациями для размещения в бизнес-инкубаторе являются начинающие субъекты малого предпринимательства, занятые в сфере наукоемких технологий. Такая расстановка приоритетов обоснована специализацией округа на развитии высокотехнологичных отраслей науки и производства.
Размещение малых предприятий научно-технической сферы на площадях бизнес-инкубатора производится по итогам конкурса. В настоящее время объявлен конкурсный отбор заявок на размещение в инкубаторе.